El Banco de Germoplasma de la UAQ, dispone de:
- Laboratorio de Semillas con equipo para el análisis de calidad.
- Dos cámaras frías a una temperatura de -20 C.
- Dos invernaderos para la caracterización y evaluación de materiales
Además de una estrecha vinculación con el Herbario de Querétaro “Dr. Jerzy Rzedowski”, el Laboratorio Nacional de Caracterización e Identificación Vegetal y el Jardín Botánico de la UAQ.