La Facultad de Ciencias Naturales ofrece cinco posgrados relacionados con disciplinas biológicas básicas y aplicadas. Todos los programas de Maestría están registrados en el Programa Nacional de Posgrado y cuentan con Beca CONACYT. 

Especialidad en Nutrición, Activación Física y Salud (ENAFyS). Formar especialistas del área de la salud de alto nivel, capaces de colaborar en equipos multidisciplinarios para implementar programas integrales de activación física y nutrición que permitan promover la salud de los diferentes sectores de la población, desde un punto de vista holístico, de acuerdo a sus perfiles profesionales.


Especialidad en Nutrición y Reproducción de Ovinos y Caprinos (ENROC). Es un programa que se orienta a la formación de especialistas en las disciplinas de alimentación, nutrición y reproducción de ovinos y caprinos, con capacidades integrales para identificar los puntos críticos que afectan los procesos de producción asociados a estas disciplinas, así como para diseñar y aplicar estrategias que permitan mejorarlos, con dominio de métodos y técnicas de actualidad.


Maestría en Salud y Producción Animal Sustentable. Programa para formar posgraduados capaces de identificar y proponer soluciones a los problemas asociados con la salud y la producción animal sustentable en forma integral, considerando los desafíos tecnológicos y científicos contemporáneos, así como contribuir al mejoramiento de la eficiencia de los sectores empresariales, sociales y gubernamentales de servicios de salud y/o producción animal, promoviendo la transferencia de la tecnología que incide en las cadenas productivas.  

Maestría en Ciencias Biológicas. La finalidad del programa es la formación de científicos en investigación biológica y profesionales para el mercado laboral en el área de las ciencias biológicas, como respuesta a las crecientes necesidades de los sectores: productivo, de investigación y académico.

Maestría en Gestión Integrada de Cuencas. Se busca capacitar a profesionales con un alto nivel académico para el mejor desempeño en sus actividades orientadas al aprovechamiento del potencial de desarrollo de la región, mediante la gestión integrada de cuencas a través de un enfoque interdisciplinario.

Maestría en Ciencias de la Nutrición Humana. Programa para formar posgraduados con capacidad de generar estrategias encaminadas a combatir la problemática de la alimentación, nutrición y salud, contribuyendo con las instancias que dedican sus esfuerzos en la atención y prevención de esta problemática, mediante proyectos técnicos y socialmente eficaces.

Maestría en Nutrición Clínica Integral. La MNCI pretende formar recursos humanos de alto nivel en el área de la nutrición clínica, cuyo ejercicio profesional en los tres niveles de atención, impacte en los problemas prioritarios de salud a nivel regional, nacional e internacional.

Doctorado en Ciencias Biológicas. Se busca la formación de recursos humanos dedicados a la investigación en las ciencias biológicas con la finalidad de atender las necesidades nacionales y regionales. Las líneas de generación y/o aplicación del conocimiento son: Sistemática y Biodiversidad. Ecología, Conservación y Manejo de Recursos Naturales. Biología Molecular, Genética y Evolución. Inmunología, Microbiología y Salud.